列挙してみると結構あります。
特にモバイルアダプタGBイベントのアイテムは公式ガイドブックにも載ってません。
(当時のプレイヤーの何%が知っていたのか気になります)
<ポケモン>
- 第一世代との通信
フシギダネ、フシギソウ、フシギバナ
ヒトカゲ、リザード、リザードン
ゼニガメ、カメール、カメックス
オムナイト、オムスター
カブト、カブトプス
フリーザー
サンダー
ファイヤー
ミュウツー
ミュウ - 第二世代との通信
メリープ、モココ、デンリュウ
キリンリキ
テッポウオ、オクタン - 第一世代または第二世代との通信
ロコン、キュウコン
マンキー、オコリザル - モバイルアダプタGBのイベント
セレビィ(※VC版は可能)
<アイテム>
- 第一世代との通信
ひかりのこな
ラッキーパンチ
メタルパウダー
ぎんのはっぱ
きんのはっぱ
まがったスプーン
でんきだま
みずたまリボン
かわらのかけら
わざマシン09(じこあんじ) - 第一世代(ポケモンスタジアム2経由)の通信
きのはこ
きりのはこ - モバイルアダプタGBのイベント
あおぞらメール
まぼろしメール
<もようがえグッズ>
以下は通信要素です。単独という意味だと入手不可の為、載せておきます。
<ポケモン>
<アイテム>
- ふしぎなおくりもの
きせきのみ
ピントレンズ
ブイブイメール
へんしんメール
おんぷメール
<もようがえグッズ>
- ふしぎなおくりもの
(もようがえグッズ全般)